Bonsai & Mimosa
Bonsai-integrationen har verifierats på NGP-klustret inom ramen för JaseBonsaiMimosa-pipelinen och har visat god funktionalitet.
Mimosa API är tillgängligt från NGP-klustret, men saknar för närvarande stöd för uppladdning av prover samt initiering av klustringsjobb via API. Vi utreder möjliga lösningar för att hantera denna begränsning.
Brainchild
Vi har satt upp nätverkskoppling mellan Brainchilds Fabric-miljö och on-prem HCP-lagring hos VGR där data är tänkt att flöda in. Utvecklare i Fabric ska i första hand nå mock-data från Barntumörbanken/Svenska Barncancerregistret.
NGPc
Vi har hittat ett sätt att skala netapp-lagringen mer dynamiskt för att kunna hantera större belastningar både vad det gäller storlek men också throughput. Grundlogiken är färdig men kräver mer arbete för att kunna tas i drift.
Systemunderhåll
Vi har diskuterat att införa regelbundna systemunderhåll en gång per månad, med start onsdagen den 10 juni och därefter den andra onsdagen varje månad.
Under dessa underhållsfönster kommer vi att genomföra systemuppdateringar, omstarter av servrar .etc.
Underhållsfönstret är planerat till kl. 09:00–17:00 och kan medföra begränsad tillgänglighet eller avbrott för NGPc (https://ood.genmed.se) under denna period. Användare ombeds att inte använda NGPc medan underhållet pågår.
/Aron C