Bonsai + Mimosa

Tidigare problem vid import av riktiga Jasen-resultat berodde på att olika versioner av GMC-noder använder olika versioner av JASEN. Den senaste releasen av Bonsai har ej stöd för JASEN 1.2, men stöd för detta är under utveckling.

Tidigare tester med mock-data bör dock vara tecken på att Bonsai och Mimosa integrationerna i NGP:n fungerar. För den pågående pilotstudien så behöver vi få förtydligat för oss vilken version av JASEN och Bonsai vi behöver ha stöd för i NGP:n.

Automation

Testar stackstorm i azure miljö. Stackstorm är en automations-mjukvara som syftar till att lösa problematiken kring när/var/hur/varför analyser ska starta på NGPc. Man kan t.ex. föreställa sig att råa prov som laddats upp i valfri bucket/namespace på NGPr ska detekteras av en Stackstorm-sensor som i sin tur “triggar” ett arbetsflöde att starta som involverar nedladdning, analys, och uppladdning.

Det är många pusselbitar som behöver sitta ihop korrekt och problem som behöver lösas, t.ex. spårbarhet av jobb när stackstorm lämnar över till grid engine och vice versa.

Autentisering

Testar vidare med en Keycloak-uppsättning med två noder som opererar under en lastbalanserare tillsammans med en gemensam databas för att försöka göra en lösning med High Availability.

Brainchild

Mer arbete med att igång arbetet med datan från BTB som kommer användas i brainchild

// Aisha Alsafi

Bonsai + Mimosa

Import av riktiga Jasen-resultat in i Bonsai har gått mindre bra. Utvecklarna har kontaktats för assistans.

En testmiljö har skapats inom HCP:n för att hålla exempelfiler för test av diverse integrationer, bland annat automatisk hämtning av data från HCP till lokal lagring för import in i Bonsai och Mimosa.

Automation

Stackstorm tittas just nu på som lösning för att lösa automationsbiten inom NGPc. Denna ska kunna agera utifrån triggers för att diktera vilka arbetsflöden som ska starta som respons. Ett primärt användningsområde skulle vara att detektera ny data inom specifika ytor på HCP:n för att sedan låta underliggande logik bestämma vilken pipeline som bör starta, samt vart resultat sedan ska skickas.

Autentisering

En uppsättning av Keycloak har gjorts där vi testar olika inloggningsflöden inom NGP. Förhoppningen är att denna ska lösa problematiken kring implementation av multipla inloggningslösningar/flöden, och stödjer bland annat SAML, OAuth2, OpenIDConnect som protokoll.

Felsökning HCP

Felsökning fortsätter för att lista ut den underliggande orsaken till de så kallade “non-replicating objects”-felen som har observerats hos HCP:n. BDC, KSD samt Hitachi är involverade i processen.

// Jens PW