Ny lagringslösning med Azure NetApp Files
Vi har etablerat och driftsatt en ny lagringslösning baserad på Azure NetApp Files för NGPc-klustret. Detta ersätter den tidigare Lustre-baserade lagringen.
Framsteg i Bonsai- och Mimosa-integrationerna
Arbetet med Bonsai och Mimosa har fortsatt med fokus på både praktisk testning och strategiska vägval:
- Mockdata har laddats upp och klustringar har genomförts framgångsrikt i både Bonsai och Mimosa.
- Vi har haft en första intern diskussion kring nästa steg i integrationerna, där vi bland annat tittar på:
- Hantering av större datamängder
- Stöd för många samtidiga användare
- Prioritering av uppladdningar och klustringar
- Data persistence
- Eventuell utbyte av MongoDB-databaserna
- Insamlad feedback har skickats vidare till Bonsai- och Mimosa-teamen, och vi har påbörjat nästa runda av frågor och synpunkter.
- Arbetet med att ladda upp JASEN-data till NGPr (HCP) har inletts, och vi har även börjat testa med verklig data.
- Nästa steg är att boka ett gemensamt möte för att konkretisera vad som krävs för att få en MVP på plats inför studien. Fokus kommer ligga på:
- När och var data ska laddas upp
- Exakt vilken data Bonsai och Mimosa behöver från JASENs output
Vidareutveckling av Variantdatabasportalen
Utvecklingen av variantdatabasportalen (VDP) fortsätter inför GMS RD-gruppens månadsmöte i början av april. Arbetet har främst fokuserat på:
- Förbättringar av befintlig funktionalitet
- Buggfixar och stabilisering
NGP IRIS – kommande release
En ny version av NGP IRIS (v5.6.7) är under utveckling. Den kommer bland annat att introducera stöd för rekursiv uppladdning av mappar, vilket innebär att mappar som innehåller undermappar kan hanteras direkt vid uppladdning.
// Erik B