Veckans uppdatering från NGP

Den här veckan har vi fortsatt arbetet med att utveckla och förbättra våra tjänster, portaler och vår infrastruktur.

Bland annat har Iris fått en ny version med förbättrad sökfunktionalitet, vi har stärkt säkerheten för administrativ åtkomst och NGP-klustret har hanterat en större mängd mikrobiologiprover. Samtidigt fortsätter förberedelserna inför NGP-dagen den 18 november.

Iris – ny version med förbättrad sökfunktionalitet

En ny version av Iris, 5.6.9, har släppts.
En av nyheterna i denna version är ny sökfunktionalitet kopplad till MQE (Matchmaking Exchange). Utöver detta har (bland annat): paket uppdaterats, test-suiten fixats och certifieringshantering har förbättrats.

VDP – fortsatt felsökning och finslipning

Även arbetet med VDP har fortsatt under veckan, med fokus på ytterligare felsökning, justeringar och finslipning av tjänsten.

Brainchild – frontendutvecklingen närmar sig färdigställande

Utvecklingen av Brainchild går framåt och de flesta delarna av frontendutvecklingen är nu färdiga. Det innebär att en stor del av arbetet med användargränssnittet har slutförts.

NGP Infrastruktur – säkrare administrativ åtkomst

Under veckan har vi satt upp en jumphost-VM för att stärka säkerheten kring administrativ åtkomst till vår infrastruktur.

Jumphosten ger vårt interna team en säkrare och mer kontrollerad väg för att administrera de virtuella maskiner som kör våra portaler och andra infrastrukturtjänster.

Lösningen lägger också en teknisk grund för att i framtiden kunna ge externa utvecklare begränsad åtkomst till specifika resurser. Den möjligheten är ännu inte implementerad, men infrastrukturen är nu förberedd för en sådan vidareutveckling.

NGP-klustret – nya VM-storlekar och ökad kapacitet

Nya VM-storlekar med mer minne per kärna

Som vi nämnde i förra veckans blogginlägg har vi utökat utbudet av virtuella maskiner i NGP-klustret (NGPc). Den här veckan vill vi ge lite mer information om vad det innebär.

De nya VM-storlekarna tillhör Esv5-serien, som erbjuder mer minne per kärna jämfört med de virtuella maskiner i D-serien som redan finns tillgängliga i klustret. Den största tillgängliga konfigurationen har för närvarande 32 trådar/slots och 256 GB minne. Det ger fler alternativ för arbetslaster som behöver större mängder minne i förhållande till antalet processorkärnor.

Mikrobiologins flaggskepp – större provvolymer i klustret

Under veckan har cirka 500 MRSA-prover bearbetats genom NGP-klustret, och ytterligare omkring 400 prover återstår att köra under nästa vecka.

Den större provvolymen gav oss samtidigt möjlighet att se hur Navops och resten av klustret hanterar en situation där många prover köas upp vid ett och samma tillfälle.

Resultatet var positivt!
Vi kunde inte se några större problem med att skala ut klustret horisontellt för att möta den ökade belastningen. Som mest hade vi
53 arbetsnoder igång samtidigt, med totalt cirka 340 processorkärnor. Det gav oss värdefulla erfarenheter av hur infrastrukturen beter sig vid större, samtidiga arbetslaster.

Förberedelser inför NGP-dagen den 18 november

Parallellt med det tekniska utvecklingsarbetet fortsätter vi att planera och förbereda olika delar inför NGP-dagen den 18 november.

Arbetet med de olika komponenterna inför dagen pågår, och vi ser fram emot evenemanget!

BDC-dagen

Trots allt hann vi också ta en dag för umgänge och teambuilding!
Det är trots allt Halloween 🎃

Hela BDC – Bioinformatiker, IT, statistiker och alla andra som inte nämns (förlåt!) samlades en hel dag för att presentera vad som pågår i de olika grenarna av BDC.

Vi delade med oss av vad vi jobbar på, vad vi vill förbättra och vad som komma skall. Det var en dag där olika grenar inom en organisation som alla jobbar mot samma mål fick insyn i varandras arbete, utmaningar och prestationer, och bidrog till en ökad förståelsen för hur vi alla bidrar och drar vårt strå till stacken.

Nya kollegor (mig inkluderat) fick också en chans att säga hej och presentera sig själva.

Och det hela avslutades med en utflykt till Liseberg, där vi kunde äta tillsammans och medverka i lite friendly competition (som togs mer eller mindre seriöst 😉). Halloween-andan i parken var på topp, och Liseberg var proppfylld med firande människor! Trots folkmassorna, eller kanske delvis tack vare dem, präglades dagen av en härlig höststämning och en mysig men sprudlande atmosfär!

Hoppas att din Halloween också bjöd på en riktigt härlig höststämning, massor av skoj och kanske en och annan spooky upplevelse…

Från oss på BDC – Happy Halloween!